Institut de la Leucémie
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Equipe de Matthieu Duchmann – Evolution clonale et plasticité des cellules leucémiques [LEAP]

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Matthieu Duchmann

Chef d’équipe

Institut de recherche Saint-Louis

Courriel
Stéphanie CHAMBAUD

Thématiques de recherche

Thématiques de recherche

Nos travaux portent sur l’hétérogénéité intra-leucémique et l’évolution clonale des leucémies aiguës myéloïdes. En analysant des prélèvements séquentiels de patients avec des protocoles de génomique en cellule unique, nous étudions comment les cellules leucémiques se diversifient, s’adaptent aux traitements et persistent pour donner lieu à des rechutes. L’objectif est de développer des approches de médecine de précision pour prévenir ou cibler ces rares cellules leucémiques persistantes.

Axes de recherche

Schéma axe de recherche Matthieu Duchmann

Cet axe vise à comprendre pourquoi, au sein d’une même leucémie, coexistent différentes populations de cellules leucémiques. Nous avons montré que certaines architectures clonales, notamment l’évolution parallèle de mutations des voies de signalisation, sont associées à des taux de rechute plus importants après traitement par chimiothérapie. Nous utilisons des approches innovantes, comme l’analyse génomique et transcriptomique à l’échelle de la cellule unique de prélèvements primaires de patients, ainsi que des modèles murins de leucémie, pour établir un lien causal entre organisation clonale et agressivité de la maladie.

Les cellules leucémiques peuvent s’adapter aux traitements, favorisant la persistance de rares cellules résiduelles responsables des rechutes. Cet axe explore ces mécanismes d’adaptation en analysant des échantillons séquentiels de patients avant et au cours du traitement avec des technologies de génomique en cellule unique, pour capturer ces étapes de plasticité leucémique. Ces études sont réalisées dans le cadre d’essai clinique prospectifs de patients traités par chimiothérapie intensive (étude DYNHAEMICS, NCT05304156) ou recevant un traitement moins intensif par AZA/VEN (étude DREAM, NCT06225128) ou ivosidenib (étude biologique sur la cohorte IDIOME, NCT06225128).

Même en rémission, de très rares cellules tumorales peuvent persister et conduire à une rechute. Nous développons des approches multiomiques en cellules uniques permettant de mieux caractériser ces cellules leucémiques résiduelles. L’objectif est d’identifier des cibles thérapeutiques spécifiques à ces cellules et de proposer des traitements préemptifs, avant la rechute cytologique. Un projet d’essai clinique vise à démontrer la faisabilité de cette stratégie et son potentiel pour guider des traitements personnalisés en situation de maladie résiduelle positive.

Membres de l’équipe de Matthieu Duchmann

Clara Blanjard
Project Manager
Nicolas Lecornec
Doctorant
Lucie Freiman
Doctorante
Nishika Gupta
Doctorante
Sofiane Fodil
Doctorant
Océane Musset
Stagiaire

Publications scientifiques

Clinical impact of genetic alterations including germline DDX41 mutations in MDS/low-blast count AML patients treated with azacitidine-based regimens

Marie Sébert & al, Leukemia, 2024

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Hematopoietic differentiation at single-cell resolution in NPM1-mutated AML

Matthieu Duchmann & al, Blood Cancer Journal, 2022

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Prognostic impact of DDX41 germline mutations in intensively treated acute myeloid leukemia patients: an ALFA-FILO study

Nicolas Duployez & al, Blood, 2022

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Offres d'emplois

Portrait Chercheur

Ingénieur.e en bioinformatique

Mise en place de nouveaux pipelines d’analyse pour des données single-cell et analyse de données multiomic pour des projets collaboratifs.

Portrait Chercheur

Doctorant.e en bioinformatique

Projet de recherche pour étudier la diversité transcriptionnelle des cellules leucémiques et son évolution en cours de traitement dans une large cohorte longitudinale de patients LAM.